模 式 種 / type species
모식종, 또는 기준종은 한 속(屬)의 여러 종(種) 중에서 대표가 되는 종이다. 특별한 예외가 없다면 특정 속 내에서 최초로 명명된 종이 그 속의 모식종으로 인정된다. 예를 들어 고니속(Cygnus)에는 여러 종(현생종 6종과 절멸종 최소 13종)이 포함되어 있는데, 이 중 가장 먼저 명명된 큰고니(Cygnus cygnus)가 해당 속의 모식종이 된다.
만약 여러 종을 포함한 속 내에서 기존의 모식종이 더 이상 유효하지 않은 종명으로 간주되거나 새로운 속으로 재분류되어 사라지는 경우에는 해당 속에서 다른 대표적인 종이 모식종으로 지정된다. 예를 들어 스테고사우루스 아르마투스가 의문명이 되어 스테고사우루스 스테놉스가 모식종이 된 것.
현생 인류인 호모 사피엔스도 호모속의 모식종이다.
당연히 아직 다른 종이 발견되지 않았거나, 다른 종이 모두 멸종한 단형인 속의 경우에는 현존하는 종에만 해당된다. 가장 적절한 예는 은행나무강에서 유일하게 현존하는 은행나무.