안타리아의 거의 모든 학술, 마법과 검술에 대해 연구하는 곳으로서, 제국령 주요 지점 곳곳에 제국 학술원의 지부가 자리잡고 있어 스토리 진행 도중 다양하고 유용한 정보를 얻을 수 있다.[2]
주인공 시라노 번스타인이 이곳의 유망한 학자였는데, 당시 학장인 마티스를 비롯한 많은 학자들이 숙청되던 금서목록 사건에 말려들어 인생을 크게 말아먹었다. 그 외에도 전작 창세기전 2의 등장인물인 제국 7용사의 비쉬누 만부터 그의 제자인 현자 기쉬네 드리포드, 체사레 보르자의 사상을 추종하던 학자 마키아벨리, 마티스를 몰아내고 학장 자리를 꿰찬 이스카리옷 등이 제국 학술원 소속이다. 특히 마키아벨리는 창세기전 3 시점까지 살아남아, 리슐리외라는 이름으로서 게이시르 제국 재상이 되었다.
체사레 보르자의 지원으로 생체실험 및 마법의 융합 실험을 겸한 어두운 면도 함께 지니고 있는데, 체사레와 이스카리옷이 이 연구성과를 이용해 그리마화하기도 한다. 사족으로 유니콘 동굴에 은거 중인 파즈 역시 제국 학술원 검 연구학회 회원이었다고 한다.
창세기전 외전 템페스트나 창세기전 3에서는 등장하지 않고,